Programme de la semaine
Voici le programme des travaux pratiques, qui se dérouleront tous les jours de 14h à 18h :
Lundi - Jour 1
- Introduction générale : programme et but des TPs et de la question biologique : le phototropisme ;
- Notions de méthodologie scientifique ;
- Quels outils emploie-t-on pour étudier la fonction d’un gène :
- Démonstration de culture in vitro, d’histologie et d’hybridation in situ ;
- Démonstration à propos de la PCR (génotypage, RT-PCR et RT-qPCR).
- Mise en place de l’expérience (celle-ci durera 2 jours).
Mardi - Jour 2
- Extraction de l’ADN génomique de plantes afin de réaliser un phénotypage ;
- Réalisation d’une PCR de génotypage.
Mercredi - Jour 3
- Visualisation des résultats de la PCR sur un gel d’agarose ;
- Récolte des données expérimentales :
- Que mesurer, comment le mesurer ?
- Démonstration d’imageJ ;
- Comment structurer les données ? Pourquoi ?
- Prise en main de R.
Jeudi - Jour 4
- Comment générer un graphique scientifique et comment rédiger une légende adéquate ?
- Utilisation de R afin de générer des graphiques présentant les données obtenues.
- Visite des zones de culture et présentation des outils dont nous disposons au B22 (“phénomaton”, chambres climatiques, etc)
Vendredi - Jour 5
- Préparation, en groupe, d’une courte présentation des résultats obtenus ;
- Présentation et débriefing commun ;