Matériel biologique et outils à disposition

Au cours de cette semaine de travaux pratiques, vous allez donc réaliser des expériences qui permettront 1) de déterminer les photorécepteurs impliqués dans le phototropisme ainsi que les couleurs auxquelles ils sont sensibles ; 2) déterminer le rôle de l’auxine et de son transport dans ce processus.

Matériel biologique

Vous allez disposer de boites de culture in vitro. Celles-ci contiennent un milieu nutritif, appelé “milieu MS”, qui fournit aux jeunes plantules les nutriments nécessaires à leur développement. Nous avons semé des boites avec les génotypes/conditions suivantes :

  • mutants phot1;phot2
  • mutants phyA
  • mutants phyb
  • mutants pin3
  • Individus sauvages (écotype Columbia-0)
  • Individus sauvages placés sur NPA (les graines ont été semées vendredi sur un milieu MS normal et, ce matin, ont été transférées sur un milieu contenant une molécule inhibitrice du transport de l’auxine, appelée NPA).

Outils à disposition

Dans le cadre de cette semaine de travaux pratiques, les données seront acquises via l’analyse d’images. Pour cela, nous allons utiliser un automate afin de collecter, toutes les 90 minutes, des images des boites sur lesquelles poussent différents génotypes d’Arabidopsis thaliana. Ces boites, exposées à différents stimuli lumineux, permettent de visualiser la progression de la réponse phototropique au cours du temps en fonction de la lumière.

Celui-ci permet donc d’évaluer la cinétique de réponse. Voici un exemple de succession d’image obtenue avec l’automate, accompagné de l’évolution de certains paramètres au cours du temps (circularité et surface totale) :

Example image

Vous disposerez d’un contenant permettant de mettre les boites à l’obscurité ainsi que de trois sources de lumière différentes :

  • Lumière blanche (mélange de tout le spectre des longueurs d’ondes visibles)
  • Lumière bleue à 450 nm
  • Lumière rouge à 660 nm

Comment allez-vous utiliser ces conditions afin de répondre à votre question biologique ? A vous de jouer !